植物抽核哪家强!伯优试剂来帮忙!杨树茎抽核及单细胞数据实测-技术前沿-资讯-生物在线

植物抽核哪家强!伯优试剂来帮忙!杨树茎抽核及单细胞数据实测

作者:上海伯豪生物技术有限公司 2024-12-19T00:00 (访问量:464)

植物作为一种固基生物,需要通过其自身的转录程序来应对日常环境暴露和面临的挑战。不同的细胞类型在植物发育和应对环境挑战中具有不同的生物学作用。精准解析植物不同组织器官的细胞图谱及功能有助于更好的理解其生物学作用机制。但是,由于植物细胞存在细胞壁,液泡且细胞大小不均一。导致植物的单细胞RNA测序(scRNA-seq)不能被广泛的推广应用。尽管通过分离原生质体可以实现scRNA-seq。但是原生质体的分离也有很大挑战。例如,不同物种和组织之间细胞壁中有机大分子的复杂成分需要特定的酶成分和浓度来水解细胞壁。同时,样品与酶的接触面积也会影响分离效率,并且原生质体的大尺寸降低了细胞的捕获效率。其次,植物细胞大小的差异很大,再加上渗透压对细胞大小的影响,可能导致实验偏差。因此,单细胞核RNA测序(snRNA-seq)是目前可以解决以上问题的最有效的方法。

为响应客户对植物细胞核分离的需求,伯豪生物自主研发上市的伯优®植物样本细胞核分离试剂盒,在裂解细胞的同时,保持了细胞核膜的稳定,并可以有效减少碎片、次生代谢产物的残留及细胞核结团或聚集等现象。目前,我们已经针对禾本科,十字花科,杨柳科,百合科,豆科等9个科的11个物种进行了细胞核分离方法建立,包括的小麦、玉米,油菜,番茄、枸杞,杨树,洋葱,菜豆等。下面给大家分享杨树茎的细胞核分离数据:

杨树茎RNA质检结果:RIN:9.2

 

杨树茎抽核结果:

(1) 细胞核数:26万左右

(2) 碎片率:25%

(3) 结团率:3%

 

杨树茎单细胞核测序数据质控

(Cell Ranger)

捕获细胞核数13594个,单个细胞中位基因达1559,数据符合质控要求。

植物样本单细胞实验的成功不仅来源于试剂的稳定性,更源自于经验的累积。不同植物样本的尝试,成百上千次的植物细胞核抽提,都会使成功概率一点点提升。我们不仅只成功了这一例,后续会有更多植物样本类型的数据结果也会依次放出,大家敬请期待!

 

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