用户文章 | 广东昆虫所陈金平组:揭示鲟鱼性别分化miRNA表达谱-技术前沿-资讯-生物在线

用户文章 | 广东昆虫所陈金平组:揭示鲟鱼性别分化miRNA表达谱

作者:联川生物技术公司 2016-05-11T14:20 (访问量:2428)

 

MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其大小长约20~25个核苷酸。miRNA参与动物转录后调控,并在调控配子形成相关基因的表达中起着非常重要的作用。但是,鲟鱼的性别决定和分化机制仍不清楚。因此,鉴定miRNA和识别与性别分化相关的miRNA表达特征对于理解miRNA在鲟鱼性分化过程中的作用是至关重要的。

 

在这项研究中,研究人员选取鲟鱼性别分化之前的五个不同组织和性腺进行miRNA表达谱分析。miRNA芯片和qPCR筛选出1037个miRNA(miRBase20.0)和103个候选miRNA。此外,还发现1140个miRNA中有477个miRNA的序列在不同鱼类中高度保守(100%)。663个非冗余的miRNA探针中,481个miRNA均在两个性别的性腺中检测到。148个miRNA被鉴定为在睾丸和卵巢之间含有性别分化表达谱(P<0.01), 21个miRNA(14.19%)在睾丸或卵巢中的表达量相对较高,倍数变化大于2。随机选择13个性别分化miRNA的芯片数据获得了qPCR验证。靶基因预测揭示了一个显著的功能富集基团(88 GO terms))和18 条KEGG通路(P<0.05),提示性别分化的miRNA和25个假定的配子形成相关的靶基因之间有相互作用。

 

因此,鲟鱼幼鱼miRNA表达谱分析为了解和进一步研究miRNAs在鲟鱼性别分化中的作用奠定了基础。

 

本研究中的microRNA微流体芯片由联川生物协助完成。

 

参考文献

 

Zhang XJ, et al. Conservation, sex-biased expression andfunctional annotation of microRNAs in the gonad of Amur sturgeon (Acipenserschrenckii). Comparative Biochemistry and Physiology, Part D 18 (2016) 54–61

 

 

回复“案例”或查看历史消息,了解更多联川合作课题组近期发表的研究工作

 

我们今年的春季巡讲将于下周(5月10日)在山东农业大学拉开帷幕!

 

回复“巡讲”,查看详情

 

联川生物技术公司 商家主页

地 址: 杭州经济技术开发区下沙6号大街260号中自科技园16幢4层

联系人: 吴先生

电 话: 0571-87662413

传 真: 0571-81951905

Email:market@lc-bio.com

相关咨询

快来围观,你离高分paper还差一个phasiRNA (2019-01-14T13:34 浏览数:4627)

如何选择合适的qRT-PCR内参基因? (2019-01-14T11:06 浏览数:18419)

为什么要做绝对定量测序-数据分析 (2018-09-21T17:59 浏览数:4421)

低通量单碱基m6A验证的新方法|m6A专题 (2018-09-18T16:04 浏览数:4420)

祝贺联川客户继Nature后又发一篇Nature Genetics (2018-09-18T16:03 浏览数:4229)

联川生物八月份客户文章汇总 (2018-09-18T16:02 浏览数:3098)

联川生物七月份客户文章汇总 (2018-09-18T16:01 浏览数:3083)

肝硬化与肝纤维化研究进展 (2018-09-18T16:01 浏览数:10904)

【用户案例】感染鲫鲤疱疹病毒2的银鲫中miRNA的差异表达 (2018-09-18T16:00 浏览数:3119)

病毒m6A专题 | HIV感染宿主促进病毒及T细胞m6A修饰 (2018-09-18T16:00 浏览数:3686)

ADVERTISEMENT