荔枝色泽鲜艳，营养丰富，具有较高的商业价值。然而，在采收后1-2天内荔枝就会变质，主要体现为果皮褐色。调控荔枝果实衰老的因素很复杂。MicroRNAs作为负调控因子参与了几乎所有的生理过程。在最新的一项研究中，中国科学院华南植物园植物资源保护与可持续利用重点实验室从miRNA水平探究了荔枝果实衰老和果皮褐变的机制。相关研究成果发表在7月刊的《BMC Plant Biology》上，朱虹副研究员是文章的共同第一作者，屈红霞研究员为文章通讯作者。
课题组选取常温贮藏和冷藏后货架期的荔枝果皮制备了5个小RNA文库和1个降解组文库并进行测序分析。通过将小RNA测序读段与组装的荔枝unigene进行比对，首次在荔枝中鉴定到296个miRNAs，属于49个已知的miRNA家族。同时，鉴定到11个荔枝特异性miRNAs。通过降解组分析，鉴定到受167个已知miRNA剪切调控的197个靶基因，和3个荔枝特异性miRNAs调控的5个靶基因。综合茎环qRT-PCR和转录组表达谱分析，发现了14组miRNA-靶基因对参与了荔枝果实衰老相关的过程，包括能量调控，花青素代谢，激素信号通路以及抗病侵染等。
图1 荔枝果实衰老过程中的miRNA调控网络
本研究构建了一个调控荔枝果实衰老的miRNA-靶基因调控网络，揭示出在衰老荔枝果实中miRNA介导的调控机制。此项研究将有助于开发延缓荔枝果实和其他园艺产品衰老的新策略。
此项研究中的小RNA测序和降解组测序分析由联川生物承担完成
参考文献
Yao F, Zhu H, Yi C, Qu H, Jiang Y. (2015) MicroRNAs and targets in senescent litchi fruit during ambient storage and post-cold storage shelf life. BMC Plant Biol. 15:181. doi: 10.1186/s12870-015-0509-2.
