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最强定量CP | 靶向代谢组学+Olink蛋白组学–双组学驱动临床疾病深层研究

作者:麦特绘谱生物科技(上海)有限公司 暂无发布时间 (访问量:15666)

麦特绘谱多年来聚焦于全定量代谢组学技术,旨在给用户带来高稳定性、可重复性、可验证性、可深度机制挖掘的高准确性定量方法,持续为用户创造围绕临床痛点问题的功能研究价值。近年来,麦特绘谱持续加速拓展以代谢组学为核心的蛋白组等多组学服务,蛋白质组学作为后基因组时代生命科学研究的核心内容之一,蛋白组学的方法层出不穷,目前,蛋白质组学平台除了最常用的液相色谱-串联质谱(LC/MSMS)平台,还包括蛋白芯片技术平台、以及巧妙结合了PCR/NGS平台的Olink定量蛋白组学技术,不同方法的原理和适用范围不同。

今天向您隆重介绍定量代谢组学黄金搭档——Olink蛋白组学技术,它与麦特绘谱经典的Q300/Q200/Q500等全定量代谢组学(每个代谢物都有一一对应的标准品及同位素内标)方法设计思路和理念高度一致,两者均为高通量靶向定量方法,因而具有高度可重复性和可验证性,是临床诊断标志物和深度功能机制研究的又一法宝。

01. 什么是Olink蛋白组学?为什么要选择Olink?

Olink蛋白组学技术是一种基于邻位延伸分析(Proximity Extension Assay,PEA)技术的蛋白质检测方法,技术的核心原理是使用一对与目标蛋白质特异性结合的抗体,每个抗体连接一个独特的DNA序列。当这对抗体与目标蛋白结合时,它们的DNA单链可互补结合,并通过DNA聚合酶催化进行延伸成双链DNA模板进行扩增,最终通过实时定量PCR(qPCR)或NGS技术检测DNA信号,实现蛋白质的定量分析。因为针对每个待测蛋白都有一对特异性的抗体与之识别并结合,相较于常规的非靶向蛋白组学技术(如基于非标记定量技术Label-free、同位素标记相对和绝对定量技术iTRAQ及TMT、以及基于质谱数据非依赖型采集模式的DIA,Olink技术具有高特异性和高灵敏度。

2020年12月7日,Olink蛋白组与英国生物样本库(UK Biobank, UKB)(目前世界上最全面的生物医学数据库和研究资源之一)一起宣布,将联合由十家顶级生物制药公司组成的联盟启动全球最大的血液蛋白组研究之一:英国生物样本库制药蛋白组学项目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)。该项目由54,406人群参与,旨在对更深入的了解疾病过程并支持创新药物的开发。

2021年7月13日,Olink Proteomics宣布,位于冰岛的deCODE genetics将引进并在内部落地Olink® Explore 3072新一代蛋白质组平台,借助Olink技术赋能NGS测序平台,对其人群队列样本进行3072个蛋白质的高质量检测分析,从而实现与既有基因组数据的多组学联用。

02. Olink适合检测哪些样本?

Olink适用于来源于人或小鼠多种生物样本,包括标准样本:血清、血浆、脑脊液;非标样本:尿液、组织、细胞和细胞培养上清、外泌体、唾液、痰液、灌洗液、鼻腔黏膜、骨髓、房水、皮肤、关节液、腹水、羊水等,因其目标明确定量准等优势在生物、医药研究和临床诊断研究中具有广阔的应用前景。

03. Olink可靶向检测哪些蛋白?

目前,Olink针对不同研究需求,可提供心血管、神经、肿瘤、肿瘤免疫、炎症、发育、代谢、免疫应答、细胞调控、神经探索、心肌代谢、器官损伤等多个方向的48~5400 panel系列检测,具体包括Target 48、Target 96、8个Target48组合而成的Target 384、以及其他N个Target48/96组合而成的panel,以及最新推出的HT5400等,其中 Target 48包含45/43个细胞因子相关蛋白生物标志物的检测, Target 96包括92个蛋白生物标志物的检测,不同的检测panel针对特定的疾病或生物通路,研究者可以按照感兴趣的应用进行panel search和匹配。

04. 与其他蛋白组学技术相比,Olink技术具有以下优势

● 高灵敏度:能够检测到极低丰度的蛋白质(fg/mL级别),甚至可以检测到单个细胞中的蛋白质。

● 高特异性:通过一对特异性抗体与目标蛋白质结合,具有较高的特异性。

● 高覆盖性:所有检测蛋白均为生物标志物,覆盖100%信号通路。

● 高重复性:使用成熟的qPCR和NGS技术作为检测手段,重复性好,数据质量高,适合大队列大数据分析。

● 全自动化:自动化样品处理流程提供了绝佳的简易性、准确性和重复性。

● 超高通量:可以同时检测成百上千种蛋白质,提供全面的蛋白质表达谱。

● 极低样本量:仅需极少量的样本(低至1µL)即可进行检测,适用于珍贵的临床样本。

● 宽动态范围:动态范围横跨近10个logs(fg–mg),覆盖高、中、低丰度蛋白。

https://medicalxpress.com/news/2021-10-genes-diseases-proteins.html

与其他蛋白组技术相比,Olink蛋白组技术在灵敏度、特异性和通量方面具有优势,特别适用于对微量样本中的蛋白质进行精准定量和鉴定,尤其针对血液样本,相比于质谱法,Olink技术可以高度特异性识别低丰度蛋白且无需进行富集或去高丰度蛋白处理

05. Olink蛋白组学技术与代谢组学技术相结合,有望为疾病早期诊断的强大助力

Olink蛋白组学技术能够以超高的灵敏度和特异性检测大量蛋白质的变化,而代谢组学技术则专注于分析生物体内的代谢物,两者结合可以从更多层面剖析临床疾病状态

●在疾病早期,往往会先出现蛋白质和代谢物的细微变化,这些变化可能在常规检测手段难以察觉时就被这两种技术捕捉到。例如,在癌症早期,通过对特定蛋白和相关代谢物的联合监测,可以发现肿瘤细胞刚开始产生异常时的信号。

● 研究人员利用这两种技术对大量临床样本进行深入分析,建立疾病早期的特征图谱。通过对比健康样本和处于疾病早期阶段的样本,精准定位具有指示意义的蛋白质和代谢物组合。

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