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环状RNA(circRNA)药物研究风生水起,RNase R不可或缺

作者:苏州近岸蛋白质科技股份有限公司 2022-04-29T15:38 (访问量:1761)


日前,由北京大学魏文胜教授领衔的研究团队,基于circRNA技术开发的新冠疫苗,在小鼠和恒河猴实验中都诱导出了有效的免疫应答,并且能够针对不同的新冠病毒变种包括德尔塔(Delta)和奥密克戎(Omicron)提供保护。该项研究在知名学术期刊《细胞》在线发表,可谓一石激起千层浪。 作为近几年兴起的突破性技术,mRNA疫苗通过脂质纳米颗粒(LNP)将mRNA导入体内来表达抗原蛋白,以刺激机体产生特异性免疫反应。新冠肺炎疫情(COVID-19)爆发后,针对性的mRNA疫苗在多种疫苗类型中脱颖而出。与此同时,诸如自复制mRNA和circRNA等新型路线也逐渐走入大众视野。 circRNA分子呈共价闭合环状结构,不含5’-Cap和3’-polyA结构,不易被RNase降解,具有较高的稳定性。魏教授团队采用了Group I核酶自催化策略来产生编码SARS-CoV-2 RBD抗原的circRNA。该种方法是将核心序列插入到环化载体,生成用于体外转录(IVT)的模板,产生线性RNA后通过Group I核酶自催化形成circRNA。在RNA环化后需要用RNase R对未环化的RNA进行消化,来达到分离circRNA的目的。
 
 
 

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图1:circRNA制备模板及环化后结构示意图(本图引自文章Circular RNA Vaccines against SARS-CoV-2 and Emerging Variants)

 


RNase R来源于大肠杆菌RNR超家族,是一种镁离子依赖性的3'—5'核糖核酸外切酶,可从3'—5'方向将RNA逐步切割成二核苷酸和三核苷酸。RNase R几乎能够消化所有线性的RNA,但不易消化环状RNA、套索结构RNA和3'端突出少于7个核苷酸的短双链RNA分子。通常用来消化线性RNA以富集circRNA或套索结构RNA。 近岸蛋白经过系列验证,重磅推出高活性 RNase R(货号:E224
 

RNase R针对Total RNA、ssRNA及circRNA的消化实验,实验证明, RNase R可以消化绝大部分的总 RNA样品,完全消化ssRNA样品,对circRNA样品起到良好的纯化效果。

 

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为了进一步验证RNase R对环状RNA无酶切作用,利用qPCR方式检测经RNase R(蓝色:近岸蛋白;绿色:对照品牌)消化后的总RNA样品中hsa_circKIF12a和hsa_circVapa基因的丰度变化,结果显示,与阴性组(橙色)相同,两个基因的丰度基本没有变化,而经RNase A(粉色)消化的样品中基因丰度明显下降,表明环状RNA耐受RNase R的消化。

 

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circRNA在生物和生物医学领域的研究越来越热,环状RNA被证实具有多种分子机制,包括调控基因的转录和翻译,调控蛋白质互作甚至可以被翻译成小肽。不仅如此,环状RNA还具有转化医学价值,它们在作为诊断性生物标志物或疾病治疗靶点方面都具有应用潜力。在利用体外环化RNA技术制备针对免疫性疾病或癌症的环状RNA药物方面,也逐步有企业加入进来,目前国内外已有数十家企业布局circRNA技术路线。相信随着研发推进,circRNA技术会迎来新一波研究和产业化热潮。

 

相关产品

 

货号 产品名称
E224 RNase R
E131 T7 High Yield RNA Transcription kit
GMP-E121 T7 RNA Polymerase, GMP Grade
GMP-E125 RNase Inhibitor, GMP Grade
GMP-M036 Pyrophosphatase, Inorganic (yeast), GMP Grade

 

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